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REPETICIONES DE MICROSATELITE []
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Autor:Guevara Fujita, Maria Luisa; Pérez Grossmann, Rodolfo Alfredo; Murga Zamalloa, Carlos; Castillo Herrera, Wilder; Fujita Alarcón, Ricardo.
Título:Estudio genético-molecular de glaucoma primario de ángulo abierto en una familia peruana sugiere nuevo locus para glaucoma^ies / Molecular genetic study of primary open-angle glaucoma in a Peruvian family suggests new locus for glaucoma
Fuente:Horiz. med. (Impresa);5(1):23-27, jun. 2005. ^btab.
Resumen:La contribución de la genética molecular al estudio de enfermedades hereditarias es innegable. Existen numerosos reportes de genes responsables de enfermedades hereditarios que facilitan al diagnóstico, pronóstico y también la posibilidad de terapias cuando se conoce el defecto molecular involucrado. Además, hay cientos de enfermedades en donde la identificación del defecto molecular está cerca porque se han localizado regiones cromosómicas específicas en donde se sabe, residen genes responsables de estas enfermedades. Una estrategia es precisamente, refinar paulatinamente esta ubicación a fin de caracterizar el defecto molecular, todo ello con miras a establecer posibles tratamientos. El glaucoma primario de ángulo abierto (GPAA) es una enfermedad hereditaria que puede llevar a la ceguera si no hay un diagnóstico temprano y tratamiento. Hasta ahora, se conocen seis genes que son responsables de la enfermedad y nuestro grupo está trabajando en la caracterización genético-molecular de GPAA en familias peruana usando marcadores microsatélites a fin de caracterizar su asociación con los seis grupos de marcadores. Reportamos el hallazgo de una familia peruana afectada con GPAA que no segrega con ninguno de los marcadores microsatélites de las diferentes regiones cromosómicas que se sabe están asociadas con la enfermedad. Esto apunto a la existencia de un nuevo locus responsable del GPAA en esta familia. (AU)^iesMolecular genetic studies are increasingly important for the study of heredity diseases and its contribution is well known. There are several hundred reports of genes responsible of genetic diseases that help in diagnosis, prognosis and possible treatment when the molecular defect is known. Primary open-angle glaucoma (POAG) is a hereditary disease that can lead to blindness if untreated. There are six known loci that can cause it and or group is working on the characterization of Peruvian families using microsatellite markers located on regions known to harbor glaucoma genes. We found a Peruvian family that does not segregate with any of the markers located near known glaucoma loci. This would account for a new locus responsible for the disease in this family. (AU)^ien.
Descriptores:Glaucoma de Ángulo Abierto
Glaucoma de Ángulo Abierto/genética
Patología Molecular
Repeticiones de Microsatélite
Familia
 Perú
Límites:Humanos
Medio Electrónico:http://www.medicina.usmp.edu.pe/horizonte/2005_I/Art4_Vol5_N1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Autor:Paredes Anaya, Mónica Yolanda; Blanco Castillo, Rafael.
Título:Asociación entre marcadores moleculares localizados en 4q y fisura labiopalatina no sindrómica en población chilena^ies / Association between molecular markers located in 4q and fissure labiopalatina not sindrómica in Chilean population
Fuente:Horiz. méd. (Impresa);4(2):75-81, dic. 2004. ^btab, ^bgraf.
Resumen:El objetivo de la presente investigación fue probar la posible asociación de uno o más microsatélites localizados en 4q25-4q33 y FLPNS. Se analizó una muestra de 51 genealogías extensas. A partir de estas genealogías se obtuvieron 51 tríos caso-progenitores, que se estudiaron con el programa extended transmisión disequilibrium test (ETDT). Además se colectó a 51 probandos y 94 controles para un estudio caso-control en población chilena y se postuló comprobar las diferencias entre ambos estudios de asociación. Se analizaron los microsatélites D4S1570, D4S1615, FGA, UCP1 y D4S1597 ubicados en 4q, utilizándose la técnica de la polimerasa en cadena (PCR) para el análisis de ADN, marcandose la hebra líder con un fluorocromo. Los resultados electroforeticos fueron analizados en un secuenciador automático ABIPRISM 377. Observándose que FGA en el grupo control y FGA, D4S1570 y D4S1597 en los pacientes estaban en equilibrio de H-W. Estos resultados implican que un estudio caso-control no es adecuado para el estudio de estos marcadores. Para obviar este problema se utilizó el programa ETDT, observándose que los microsatélites D4S1570, UCP1 y D4S1597 presentaron una asociación tipo alélica en familias multiples. Estos resultados sugiere que estos microsatélites se encontrarían cerca de 1 o más genes candidatos de esta malformación en la región eq24-4q31. (AU)^iesThe objective of this investigation is to test the hypothesis of the possible association of one or more microsatellites located on 4q25-4q33 with NSCLP. In this study a sample of 51 extended pedigrees were analyzed. From these pedigrees a sample of 51 case-parents trios was obtained. A novel genetic analysis was carried out using the Extended Transmission Disequilibrium Test (ETDT). Also a case control study was carried out with the 51 probands of the case-parents trios plus a sample of 94 controls of the Chilean population to test if differences were observed resulting from the methods used for the association studies. Microsatellites D4S1570, D4S1615, FGA, UCPI and D4S1597 located in 4q were analyzed. The polymerase chain reaction (PCR) was used for analysis of DNA. Forward primers were marked with fluorescent-dye-Iabel. Electrophoresis and analyses were carried out in an ABI PRISM 377 automatic sequencer. In the case-control study, only FGA was in H-W equilibrium in controls, whereas FGA, D4S1570 y D4S1597 were in H-W equilibrium in cases. These results imply that a case control study does not represent an adequate procedure to carry out an association study between the aforementioned micro satellites and NSCLP. In order to obviate this problem the ETDT program was used. From all of the analyzed microsatellites, D4S1570, UCPl and D4S 1597 presented significant allele wise association in those case-parents trios to multiplex families. This result suggests that these microsatellites would be located close to one or more candidate genes for this malformation in 4q24-4q31. (AU)^ien.
Descriptores:Marcadores Genéticos
Repeticiones de Microsatelite
Lugares Marcados de Secuencia
Enfermedades Genéticas Congénitas/diagnóstico
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Labio Leporino/genética
Fisura del Paladar/genética
Estudios de Casos y Controles
Límites:Humanos
Masculino
Femenino
Medio Electrónico:http://www.medicina.usmp.edu.pe/horizonte/2004_II/Art8_Vol4_N2.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Lindo Samanamud, Demetrio Saúl; Cornejo Olivas, Mario Reynaldo; Ortega, Olimpio; Marca Ysabel, María Victoria; Espinoza Huertas, Keren Antonieta; Mazzetti Soler, Pilar Elena.
Título:Estrategia de genotipado del gen FMR1: método de diagnóstico alternativo para el Síndrome X Frágil y otras enfermedades por expansión de trinucleotidos^ies / Genotyping strategy for the FMR1 gene: An alternative diagnostic method for the Fragile X syndrome and other trinucleotide expansion diseases
Fuente:Rev. méd. hered;24(4):269-276, oct.-dic. 2013. ^bilus, ^bgraf.
Resumen:Objetivos: Diseñar una estrategia alternativa por PCR para el genotipado de secuencias ricas en citosinas, basada en modificación nucleotídica. Material y métodos: Se modificó el gen FMR1 nativo de ocho individuos clínicamente no afectados por el Síndrome X frágil, cambiando las citosinas por uracilos, empleando bisulfito de sodio. El ADN modificado fue purificado y cuantificado por espectrofotometría. Las estructuras alternativas y potenciales islas CpG que adopta el microsatélite inestable fueron simuladas con los programas MFOLD y CpGplot. Se generaron cebadores específicos que hibriden tanto con el microsatélite modificado (Primer T) y con una secuencia modificada de las islas CpG (Primer M), utilizando el programa MethPrimer. Finalmente, ambas secuencias fueron amplificadas por PCR y los amplicones fueron separados por electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE por sus siglas en inglés) al 6% y visualizados con tinción de nitrato de plata. Resultados: La modificación del ADN fue evidenciada por espectrofotometría al uracilo. Las estructuras observadas en la simulación fueron las horquillas encontrándose dos potenciales islas CpG. La amplificación con los cebadores T, confirmó el diseño insilico desarrollado para abordar la estructura en horquillas. La amplificación con los cebadores M permitió detectar metilación de la primera isla CpG del gen FMR1. Conclusión: Se propone un diseño alternativo para amplificación de secuencias de microsatélite que contengan citosinas metiladas y no metiladas. Se requieren estudios posteriores con muestras de ADN que contengan microsatélites muy expandidos para validar su aplicación para diagnóstico molecular. (AU)^iesObjectives: To design an alternative strategy for genotyping cytosine-rich sequences using PCR and nucleotide modification. Methods: The FMR1 gene wild type was modified in the DNA obtained from eight individuals clinically unaffected for Fragile X Syndrome; cytosines were replaced by uracils using sodium bisulfite. Modified DNA was purified and quantified by spectrophotometry. Alternative structures and potential CpG islands of the unstable microsatellite were simulated using MFOLD and CpGplot tools. Specific primers were generated to hybridize with both the modified microsatellite (Primer G) and a modified sequence of CpG islands (Primer M) using the MethPrimersoftware. Finally, both sequences were amplified by PCR and the amplicons were separated by electrophoresis in silver-stained PAGE 6% gels. Results: The DNA modification was evidenced by spectrophotometry to uracil. We found two potential CpG islands. The amplification with T primers confirmed the “in silico” design developed to engage hairpin structures. The amplification with M primers detected methylation of the first CpG island in the FMR1 gene. Conclusion: We propose an alternative design for amplifying microsatellite sequences that contain methylated and unmethylated cytosine bases. Further studies are required with DNA samples containing expanded microsatellites to validate its molecular diagnostic application. (AU)^ien.
Descriptores:Genes
Síndrome del Cromosoma X Frágil/diagnóstico
Reacción en Cadena de la Polimerasa/utilización
ADN-Citosina Metilasas
Uracilo
Repeticiones de Microsatélite
Medio Electrónico:http://www.upch.edu.pe/vrinve/dugic/revistas/index.php/RMH/article/view/269/236 / es
Localización:PE1.1



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